Zgodnie z art. 8, ust. 5 rozporządzenia, państwowa instytucja kontrolna zatwierdzająca prywatną kontrolę powinna początkowo uwzględniać cztery kryteria: program kontroli standardowej, system sankcji, wyposażenie i obiektywność. Kryterium obiektywności powinno zagwarantować, że organizacja, która podejmuje decyzję o akceptacji określonego gospodarstwa lub produktu, jest niezależna od interesów kontrolowanego. Kontrolowane przedsiębiorstwo i organizacja kontrolna nie mogą być w zbyt bliskich stosunkach ze sobą, gdyż interesy obu stron nie są jednakowe. Organizacja kontrolna musi mieć możliwość ustalania warunków, wymierzania kar lub odmowy atestu, bez presji osobistej i ekonomicznej. Nie może występować w nadmiernym stopniu zależność towarzysko i gospodarcza. Rozporządzenie dopuszcza istnienie struktur kontrolnych, które zostały utworzone przez organizacje rolnictwa ekologicznego dla gospodarstw członkowskich. W ten sposób chce się wykorzystać zalety koleżeńskich systemów kontrolnych, wyrażające się szczególnym doświadczeniem fachowym kontrolujących. Jako rywale wobec atestowanych gospodarstw, rolnicy-inspektorzy często zmagają się z takimi samymi trudnościami, dzięki czemu potrafią świetnie rozpoznać czynniki mogące skłaniać do oszustwa.
